Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms