Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RykQ01887 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RykQ01887 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RykQ01887 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RykQ01887 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RykQ01887 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RykQ01887 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RykQ01887 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RykQ01887 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RykQ01887 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RykQ01887 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RykQ01887 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RykQ01887 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RykQ01887 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RykQ01887 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RykQ01887 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RykQ01887 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RykQ01887 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RykQ01887 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RykQ01887 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RykQ01887 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RykQ01887 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RykQ01887 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RykQ01887 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RykQ01887 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RykQ01887 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RykQ01887 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RykQ01887 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RykQ01887 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RykQ01887 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RykQ01887 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RykQ01887 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RykQ01887 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RykQ01887 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RykQ01887 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RykQ01887 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RykQ01887 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RykQ01887 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms