Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VcpQ01853 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms