Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd1Q01822 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd1Q01822 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd1Q01822 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms