Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SelpQ01102 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelpQ01102 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelpQ01102 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelpQ01102 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelpQ01102 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelpQ01102 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SelpQ01102 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelpQ01102 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms