Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp1Q00915 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms