Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbp4Q00724 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms