Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pax8Q00288 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms