Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PgrQ00175 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PgrQ00175 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PgrQ00175 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PgrQ00175 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PgrQ00175 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PgrQ00175 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms