Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AlkP97793 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AlkP97793 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AlkP97793 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AlkP97793 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AlkP97793 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AlkP97793 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AlkP97793 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AlkP97793 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AlkP97793 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AlkP97793 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AlkP97793 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AlkP97793 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AlkP97793 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AlkP97793 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AlkP97793 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AlkP97793 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AlkP97793 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AlkP97793 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AlkP97793 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AlkP97793 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AlkP97793 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AlkP97793 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AlkP97793 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AlkP97793 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AlkP97793 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AlkP97793 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AlkP97793 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AlkP97793 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AlkP97793 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AlkP97793 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AlkP97793 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AlkP97793 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AlkP97793 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AlkP97793 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AlkP97793 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AlkP97793 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AlkP97793 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AlkP97793 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AlkP97793 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AlkP97793 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AlkP97793 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AlkP97793 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AlkP97793 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AlkP97793 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AlkP97793 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AlkP97793 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AlkP97793 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AlkP97793 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AlkP97793 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AlkP97793 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AlkP97793 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AlkP97793 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AlkP97793 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AlkP97793 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AlkP97793 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AlkP97793 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AlkP97793 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AlkP97793 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AlkP97793 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AlkP97793 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AlkP97793 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AlkP97793 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AlkP97793 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms