Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas2P97460 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Npas2P97460 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms