Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frg1P97376 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms