Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkp1P97350 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp1P97350 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms