Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgif1P70284 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms