Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf6P70196 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms