Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrig1P70193 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms