Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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