Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3P62908 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3P62908 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms