Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms