Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms