Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnnP61807 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnnP61807 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnnP61807 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnnP61807 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnnP61807 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SnnP61807 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnnP61807 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnnP61807 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnnP61807 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnnP61807 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnnP61807 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnnP61807 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnnP61807 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnnP61807 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnnP61807 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnnP61807 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnnP61807 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnnP61807 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnnP61807 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnnP61807 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnnP61807 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnnP61807 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnnP61807 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnnP61807 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms