Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vbp1P61759 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms