Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg6P61406 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg6P61406 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg6P61406 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg6P61406 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg6P61406 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg6P61406 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg6P61406 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg6P61406 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms