Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxbp1P58501 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms