Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.4 ms