Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp4P57724 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms