Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NcstnP57716 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NcstnP57716 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms