Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5bP56480 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5bP56480 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms