Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PctpP53808 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PctpP53808 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PctpP53808 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PctpP53808 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PctpP53808 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PctpP53808 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PctpP53808 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PctpP53808 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PctpP53808 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PctpP53808 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PctpP53808 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PctpP53808 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PctpP53808 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PctpP53808 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PctpP53808 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PctpP53808 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PctpP53808 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PctpP53808 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PctpP53808 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PctpP53808 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PctpP53808 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PctpP53808 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PctpP53808 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PctpP53808 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms