Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RabggtbP53612 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms