Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcnfP51944 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CcnfP51944 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CcnfP51944 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcnfP51944 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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