Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RorcP51450 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
RorcP51450 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RorcP51450 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RorcP51450 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RorcP51450 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RorcP51450 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RorcP51450 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RorcP51450 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RorcP51450 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RorcP51450 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RorcP51450 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RorcP51450 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RorcP51450 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RorcP51450 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RorcP51450 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RorcP51450 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RorcP51450 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RorcP51450 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RorcP51450 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RorcP51450 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RorcP51450 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RorcP51450 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RorcP51450 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RorcP51450 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RorcP51450 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RorcP51450 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RorcP51450 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RorcP51450 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RorcP51450 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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