Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RoraP51448 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RoraP51448 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RoraP51448 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RoraP51448 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RoraP51448 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RoraP51448 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RoraP51448 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RoraP51448 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RoraP51448 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RoraP51448 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RoraP51448 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RoraP51448 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RoraP51448 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RoraP51448 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RoraP51448 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RoraP51448 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RoraP51448 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RoraP51448 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RoraP51448 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RoraP51448 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RoraP51448 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RoraP51448 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RoraP51448 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RoraP51448 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RoraP51448 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RoraP51448 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RoraP51448 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RoraP51448 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RoraP51448 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RoraP51448 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RoraP51448 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RoraP51448 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RoraP51448 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RoraP51448 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms