Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa6P50704 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa6P50704 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa6P50704 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa6P50704 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa6P50704 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms