Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt6aP50446 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt6aP50446 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt6aP50446 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt6aP50446 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt6aP50446 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt6aP50446 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt6aP50446 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt6aP50446 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt6aP50446 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt6aP50446 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt6aP50446 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt6aP50446 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt6aP50446 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt6aP50446 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt6aP50446 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms