Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb42P49222 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms