Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli1P47806 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli1P47806 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli1P47806 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gli1P47806 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gli1P47806 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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