Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr7P47774 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms