Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmx2P43687 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms