Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf4P43488 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms