Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ItgavP43406 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgavP43406 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgavP43406 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgavP43406 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgavP43406 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms