Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf9P41274 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tnfsf9P41274 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf9P41274 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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