Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms