Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik2P39087 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik2P39087 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms