Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TtlP38585 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtlP38585 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtlP38585 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtlP38585 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtlP38585 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtlP38585 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtlP38585 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtlP38585 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtlP38585 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtlP38585 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtlP38585 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtlP38585 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtlP38585 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TtlP38585 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtlP38585 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtlP38585 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtlP38585 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtlP38585 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtlP38585 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TtlP38585 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TtlP38585 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtlP38585 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtlP38585 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtlP38585 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtlP38585 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtlP38585 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtlP38585 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtlP38585 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtlP38585 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtlP38585 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtlP38585 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtlP38585 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtlP38585 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TtlP38585 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TtlP38585 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtlP38585 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtlP38585 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtlP38585 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TtlP38585 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms