Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HmgclP38060 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgclP38060 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgclP38060 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HmgclP38060 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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HmgclP38060 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HmgclP38060 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HmgclP38060 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgclP38060 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HmgclP38060 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HmgclP38060 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HmgclP38060 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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