Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig1P37913 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig1P37913 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms