Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprkP35822 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprkP35822 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprkP35822 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprkP35822 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PtprkP35822 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprkP35822 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprkP35822 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprkP35822 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprkP35822 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprkP35822 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprkP35822 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprkP35822 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprkP35822 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms