Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptpn11P35235 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptpn11P35235 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptpn11P35235 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptpn11P35235 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptpn11P35235 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptpn11P35235 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptpn11P35235 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptpn11P35235 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptpn11P35235 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptpn11P35235 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptpn11P35235 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptpn11P35235 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptpn11P35235 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms