Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifnar1P33896 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms